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充分了解品系纯度和真实性，对于新品种审定、保护及种质材料评价等具有重要意义。通过SSR或SNP分子标记分析 DNA水平上的差异来鉴定品种纯度，具有准确度高、速度快、操作简单等优点，因而被广泛应用。
实生选种和杂交育种是选育新品种最常见的方法。实生选种简单快捷，但缺乏父本信息。杂交育种周期长，由于育种园的更替和变迁、实验记录遗失等原因，常会造成亲本信息缺失的现象，给优良品种的知识产权保护育种谱系建立带来困难，也给深入认识优良性状的形成机制和遗传规律带来不便。
利用分子标记与目标性状基因紧密连锁的特点，通过检测分子标记，来进一步检测目标候选基因的存在，从而达到选择目标性状(如高产、稳产、优质、抗逆等)的目的。
遗传多样性分析为研究物种起源、品种分类、亲本选配和品种保护提供了科学依据，是收集、保护和有效利用种质资源的技术基础，有利于培育出更优良的品种。分子标记技术因其具有较高的多态性，可以更好地应用于种质资源鉴定，是种质资源材料鉴定、种质资源保护的重要手段。
大肠杆菌表达系统目前仍然是许多异源蛋白表达的选择，因为大肠杆菌操作简单、易于培养、获得的目标蛋白表达量大、成本较低以及实验周期短等优势。其主要流程包括:原核表达载体的构建一转化到高效表达的宿主菌一目的蛋白的诱导表达一细菌的扩大培养→制备细菌蛋白粗提物一目的蛋白质的纯化。
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